Skip to content
Open
Show file tree
Hide file tree
Changes from all commits
Commits
File filter

Filter by extension

Filter by extension

Conversations
Failed to load comments.
Loading
Jump to
Jump to file
Failed to load files.
Loading
Diff view
Diff view
24 changes: 22 additions & 2 deletions README.md
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,3 +1,23 @@
# 3D_DNA
# Modelo 3D do DNA com Biopython e PyOpenGL

Modelo 3D do DNA utilizando as bibliotecas Biopython e PyOpenGL para criar uma representação gráfica do elemento em questão
Este projeto consiste em utilizar as bibliotecas Biopython e PyOpenGL para criar um modelo em 3D do DNA.

## Pré-requisitos

Antes de executar o projeto, é necessário instalar as bibliotecas Biopython e PyOpenGL. Você pode fazer isso através dos seguintes comandos:

pip install biopython
pip install PyOpenGL
pip install PyOpenGL_accelerate

Além disso, é importante ter um conhecimento básico em Biologia Molecular e programação em Python.

## Utilização

Para utilizar o modelo 3D do DNA, execute o arquivo `dna_model.py` através do terminal ou de um ambiente de desenvolvimento Python. O modelo será exibido em uma janela gráfica.

Caso deseje mudar as configurações do modelo, como a posição do observador e o zoom, altere os valores das constantes no início do arquivo `dna_model.py`.

## Licença

Este projeto está licenciado sob a licença \[MIT]. Leia o arquivo LICENSE para mais detalhes.
53 changes: 0 additions & 53 deletions dna.py

This file was deleted.

36 changes: 36 additions & 0 deletions test/dna-test.py
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -0,0 +1,36 @@
import numpy as np
from Bio.PDB import PDBParser
from OpenGL.GL import *
from OpenGL.GLUT import *
from OpenGL.GLU import *

# Definindo as conts para visualização (janela/camera)
WINDOW_TITLE = "DNA Humano"
WINDOW_WIDTH = 800
WINDOW_HEIGHT = 600
FOV = 45
NEAR = 1
FAR = 50
CAMERA_POS = (0, 0, -15)
CAMERA_TARGET = (0, 0, 0)
CAMERA_UP = (0, 1, 0)

# Definindo uma função para carregar a estrutura do DNA a partir de um arquivo PDB
def load_dna_structure(pdb_file):
parser = PDBParser(QUIET=True)
structure = parser.get_structure('DNA', pdb_file)
model = structure[0]
return model

# Definindo uma função para desenhar a estrutura do DNA usando linhas
def draw_dna_model(model):
glLineWidth(2.0)
glBegin(GL_LINE)
for chain in model.get_chains():
for residue in chain:
for atom in residue:
if atom.get_name() == "p":
x, y, z = atom.get_coord()
glVertex3f(x, y, z)
glEnd()